On distingue deux marais en Vendée, l'un au Nord (Marais Breton) et l'autre au Sud du département (Marais Poitevin).

• Marais Breton : cet ancien marais salant, protégé par des digues, se positionne en dessous du niveau des hautes marées.Le Marais Breton est caractérisé par un paysage plat, ouvert sur de vastes prairies naturelles et quadrille par un réseau de canaux. L’influence maritime (embruns, eaux saumâtres) détermine une végétation spécifique.

• Marais Poitevin : son sol est essentiellement argileux, excepte quelques îlots calcaires.Asséché par l’Homme depuis le Moyen Age a des fins agricoles, il se compose de deux territoires complémentaires et distincts :
       - le Marais desséché : ancien marais salant ou l’eau des canaux parfois saumâtre. Territoire plat, ouverts sur de grands champs cultivés. Marais quadrille par un réseau de canaux, ou l’arbre est quasiment absent.
       - le Marais Mouille : inondable au moment des crues, traversé par la Sèvre et ses affluents.Il offre un paysage découpé par des fosses ou les chemins d’eau ceinturent les parcelles. L’exploitation du bois, le pâturage et le maraîchage, constituent les ressources de ce marais nomme aussi Venise Verte.

Le littoral, l’île de Noirmoutier et l’île d’Yeu, composent une façade océane variée, sur plus de 240km. Un littoral ou les dunes forment un ensemble naturel fragile.
La végétation joue alors un rôle capital dans leur maintien. Le cordon, dunaire se divise en trois dunes : la dune blanche plantée d’Oyats, cotie l’océan, la dune grise, conquise par une végétation arbustive, et la dune boisée, plantée d’arbres.

Avec la proximité de la mer, la teneur en sel dans le sol et le vent est très élevée. Celle-ci va en décroissant vers l’intérieur du pays, modifiant visiblement la végétation.
Deux îles, deux territoires distincts : Noirmoutier s’inspire du continent, avec un cordon dunaire boisé, une plaine et des marais ; l’île d’Yeu alterne les plages sablonneuses et les cotes rocheuses abruptes.